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生态环境创新中心主要依托环境科学与工程学院、化学化工学院、材料科学与工程学院、药学院、中国城市治理研究院等院系，聚焦土壤-地下水污染修复、流域性水污染控制、沙化土壤改良、矿山修复、区域大气污染控制与治理、废弃物处理处置与资源化等方向。